Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6482F6YHC1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6482F6YHC1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6482F6YHC1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6482F6YHC1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6482F6YHC1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6482F6YHC1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6482F6YHC1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm6482F6YHC1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6482F6YHC1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6482F6YHC1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6482F6YHC1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6482F6YHC1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6482F6YHC1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6482F6YHC1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6482F6YHC1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6482F6YHC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6482F6YHC1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6482F6YHC1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm6482F6YHC1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm6482F6YHC1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm6482F6YHC1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm6482F6YHC1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm6482F6YHC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm6482F6YHC1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms