Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17093F6XGJ4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm17093F6XGJ4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm17093F6XGJ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm17093F6XGJ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm17093F6XGJ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17093F6XGJ4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17093F6XGJ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm17093F6XGJ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17093F6XGJ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm17093F6XGJ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17093F6XGJ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17093F6XGJ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm17093F6XGJ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms