Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M11F6U8V3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M11F6U8V3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-M11F6U8V3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-M11F6U8V3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M11F6U8V3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M11F6U8V3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-M11F6U8V3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-M11F6U8V3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-M11F6U8V3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-M11F6U8V3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-M11F6U8V3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-M11F6U8V3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M11F6U8V3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M11F6U8V3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M11F6U8V3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M11F6U8V3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms