Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm17555F6U8B9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17555F6U8B9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17555F6U8B9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm17555F6U8B9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm17555F6U8B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17555F6U8B9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm17555F6U8B9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm17555F6U8B9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17555F6U8B9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm17555F6U8B9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm17555F6U8B9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms