Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf212F6TQD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf212F6TQD1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf212F6TQD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf212F6TQD1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf212F6TQD1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf212F6TQD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf212F6TQD1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf212F6TQD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf212F6TQD1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf212F6TQD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms