Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17669F6QL70 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm17669F6QL70 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm17669F6QL70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm17669F6QL70 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm17669F6QL70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm17669F6QL70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm17669F6QL70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17669F6QL70 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm17669F6QL70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm17669F6QL70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17669F6QL70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm17669F6QL70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm17669F6QL70 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17669F6QL70 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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