Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Herc6F2Z461 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Herc6F2Z461 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc6F2Z461 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc6F2Z461 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc6F2Z461 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc6F2Z461 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc6F2Z461 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc6F2Z461 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc6F2Z461 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc6F2Z461 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc6F2Z461 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc6F2Z461 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc6F2Z461 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Herc6F2Z461 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Herc6F2Z461 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc6F2Z461 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Herc6F2Z461 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Herc6F2Z461 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Herc6F2Z461 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Herc6F2Z461 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Herc6F2Z461 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Herc6F2Z461 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Herc6F2Z461 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Herc6F2Z461 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Herc6F2Z461 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Herc6F2Z461 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Herc6F2Z461 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Herc6F2Z461 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Herc6F2Z461 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Herc6F2Z461 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms