Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nolc1E9Q5C9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Nolc1E9Q5C9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nolc1E9Q5C9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Nolc1E9Q5C9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Nolc1E9Q5C9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nolc1E9Q5C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nolc1E9Q5C9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Nolc1E9Q5C9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nolc1E9Q5C9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nolc1E9Q5C9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Nolc1E9Q5C9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nolc1E9Q5C9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nolc1E9Q5C9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nolc1E9Q5C9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Nolc1E9Q5C9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nolc1E9Q5C9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nolc1E9Q5C9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nolc1E9Q5C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nolc1E9Q5C9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nolc1E9Q5C9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Nolc1E9Q5C9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nolc1E9Q5C9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Nolc1E9Q5C9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nolc1E9Q5C9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nolc1E9Q5C9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nolc1E9Q5C9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Nolc1E9Q5C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nolc1E9Q5C9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nolc1E9Q5C9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nolc1E9Q5C9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nolc1E9Q5C9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Nolc1E9Q5C9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nolc1E9Q5C9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nolc1E9Q5C9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nolc1E9Q5C9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nolc1E9Q5C9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nolc1E9Q5C9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nolc1E9Q5C9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nolc1E9Q5C9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nolc1E9Q5C9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Nolc1E9Q5C9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nolc1E9Q5C9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nolc1E9Q5C9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nolc1E9Q5C9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nolc1E9Q5C9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Nolc1E9Q5C9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nolc1E9Q5C9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nolc1E9Q5C9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nolc1E9Q5C9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nolc1E9Q5C9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nolc1E9Q5C9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nolc1E9Q5C9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms