Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3020E9Q3J7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3020E9Q3J7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3020E9Q3J7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3020E9Q3J7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3020E9Q3J7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3020E9Q3J7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3020E9Q3J7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3020E9Q3J7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3020E9Q3J7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3020E9Q3J7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3020E9Q3J7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3020E9Q3J7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3020E9Q3J7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3020E9Q3J7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3020E9Q3J7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3020E9Q3J7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3020E9Q3J7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3020E9Q3J7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3020E9Q3J7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3020E9Q3J7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3020E9Q3J7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3020E9Q3J7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms