Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt90E9Q1Z0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt90E9Q1Z0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt90E9Q1Z0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt90E9Q1Z0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt90E9Q1Z0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt90E9Q1Z0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt90E9Q1Z0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt90E9Q1Z0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt90E9Q1Z0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt90E9Q1Z0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt90E9Q1Z0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt90E9Q1Z0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt90E9Q1Z0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt90E9Q1Z0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt90E9Q1Z0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt90E9Q1Z0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt90E9Q1Z0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt90E9Q1Z0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt90E9Q1Z0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt90E9Q1Z0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt90E9Q1Z0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt90E9Q1Z0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt90E9Q1Z0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt90E9Q1Z0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt90E9Q1Z0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt90E9Q1Z0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms