Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r80E9Q1L0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r80E9Q1L0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r80E9Q1L0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r80E9Q1L0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r80E9Q1L0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r80E9Q1L0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r80E9Q1L0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn2r80E9Q1L0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn2r80E9Q1L0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r80E9Q1L0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r80E9Q1L0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn2r80E9Q1L0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn2r80E9Q1L0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r80E9Q1L0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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