Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8127E9Q0P0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm8127E9Q0P0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8127E9Q0P0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8127E9Q0P0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8127E9Q0P0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8127E9Q0P0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8127E9Q0P0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8127E9Q0P0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8127E9Q0P0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8127E9Q0P0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8127E9Q0P0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8127E9Q0P0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8127E9Q0P0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8127E9Q0P0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8127E9Q0P0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8127E9Q0P0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm8127E9Q0P0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8127E9Q0P0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8127E9Q0P0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8127E9Q0P0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms