Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc28a1E9PXX9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc28a1E9PXX9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc28a1E9PXX9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc28a1E9PXX9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc28a1E9PXX9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc28a1E9PXX9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc28a1E9PXX9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc28a1E9PXX9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc28a1E9PXX9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc28a1E9PXX9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc28a1E9PXX9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc28a1E9PXX9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc28a1E9PXX9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc28a1E9PXX9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc28a1E9PXX9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc28a1E9PXX9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc28a1E9PXX9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc28a1E9PXX9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc28a1E9PXX9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc28a1E9PXX9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc28a1E9PXX9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc28a1E9PXX9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc28a1E9PXX9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc28a1E9PXX9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc28a1E9PXX9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms