Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ8

Vmn2r90, Vomeronasal 2, receptor 90, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r90E9PXJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r90E9PXJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r90E9PXJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r90E9PXJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn2r90E9PXJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn2r90E9PXJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r90E9PXJ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r90E9PXJ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r90E9PXJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r90E9PXJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r90E9PXJ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r90E9PXJ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r90E9PXJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r90E9PXJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r90E9PXJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r90E9PXJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r90E9PXJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r90E9PXJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms