Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl3lE9PWZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl3lE9PWZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl3lE9PWZ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl3lE9PWZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl3lE9PWZ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl3lE9PWZ3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl3lE9PWZ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl3lE9PWZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpl3lE9PWZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl3lE9PWZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl3lE9PWZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl3lE9PWZ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl3lE9PWZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpl3lE9PWZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl3lE9PWZ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms