Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc8D3YZV8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc8D3YZV8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc8D3YZV8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc8D3YZV8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc8D3YZV8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc8D3YZV8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc8D3YZV8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc8D3YZV8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc8D3YZV8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc8D3YZV8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc8D3YZV8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc8D3YZV8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc8D3YZV8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc8D3YZV8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc8D3YZV8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc8D3YZV8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc8D3YZV8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc8D3YZV8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc8D3YZV8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc8D3YZV8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc8D3YZV8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc8D3YZV8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc8D3YZV8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc8D3YZV8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc8D3YZV8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc8D3YZV8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc8D3YZV8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc8D3YZV8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms