Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX5

Prr23a2, MCG140662, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr23a2D3YWX5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prr23a2D3YWX5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr23a2D3YWX5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr23a2D3YWX5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr23a2D3YWX5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr23a2D3YWX5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prr23a2D3YWX5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr23a2D3YWX5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr23a2D3YWX5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr23a2D3YWX5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr23a2D3YWX5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms