Protein–RNA interactions for Protein: D0VYS2

Hsf3, Heat shock factor protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf3D0VYS2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hsf3D0VYS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hsf3D0VYS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hsf3D0VYS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hsf3D0VYS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hsf3D0VYS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hsf3D0VYS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hsf3D0VYS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hsf3D0VYS2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hsf3D0VYS2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hsf3D0VYS2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hsf3D0VYS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hsf3D0VYS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hsf3D0VYS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hsf3D0VYS2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hsf3D0VYS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hsf3D0VYS2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hsf3D0VYS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hsf3D0VYS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hsf3D0VYS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hsf3D0VYS2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hsf3D0VYS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hsf3D0VYS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hsf3D0VYS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hsf3D0VYS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hsf3D0VYS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hsf3D0VYS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hsf3D0VYS2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hsf3D0VYS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hsf3D0VYS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms