Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm17333C6EQI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17333C6EQI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm17333C6EQI3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm17333C6EQI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17333C6EQI3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17333C6EQI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17333C6EQI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm17333C6EQI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm17333C6EQI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm17333C6EQI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm17333C6EQI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm17333C6EQI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms