Protein–RNA interactions for Protein: B9EJQ9

Rhox3g, Reproductive homeobox 3G, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3gB9EJQ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox3gB9EJQ9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox3gB9EJQ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox3gB9EJQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rhox3gB9EJQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox3gB9EJQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox3gB9EJQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox3gB9EJQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3gB9EJQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3gB9EJQ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhox3gB9EJQ9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms