Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clip3B9EHT4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip3B9EHT4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip3B9EHT4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip3B9EHT4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip3B9EHT4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip3B9EHT4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip3B9EHT4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip3B9EHT4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip3B9EHT4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip3B9EHT4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip3B9EHT4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip3B9EHT4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip3B9EHT4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip3B9EHT4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip3B9EHT4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip3B9EHT4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip3B9EHT4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip3B9EHT4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip3B9EHT4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip3B9EHT4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip3B9EHT4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip3B9EHT4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip3B9EHT4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip3B9EHT4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip3B9EHT4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip3B9EHT4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip3B9EHT4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clip3B9EHT4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clip3B9EHT4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clip3B9EHT4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clip3B9EHT4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clip3B9EHT4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms