Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprbB2RU80 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprbB2RU80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprbB2RU80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprbB2RU80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprbB2RU80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprbB2RU80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprbB2RU80 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprbB2RU80 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprbB2RU80 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprbB2RU80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprbB2RU80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprbB2RU80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprbB2RU80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprbB2RU80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprbB2RU80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprbB2RU80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprbB2RU80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprbB2RU80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprbB2RU80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprbB2RU80 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprbB2RU80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms