Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf3B2RQG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf3B2RQG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf3B2RQG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Phf3B2RQG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf3B2RQG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf3B2RQG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf3B2RQG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Phf3B2RQG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf3B2RQG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf3B2RQG2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf3B2RQG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf3B2RQG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf3B2RQG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf3B2RQG2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf3B2RQG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf3B2RQG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf3B2RQG2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf3B2RQG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf3B2RQG2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf3B2RQG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf3B2RQG2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf3B2RQG2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf3B2RQG2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf3B2RQG2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf3B2RQG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf3B2RQG2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf3B2RQG2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phf3B2RQG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phf3B2RQG2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms