Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brpf3B2KF05 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brpf3B2KF05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brpf3B2KF05 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brpf3B2KF05 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brpf3B2KF05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brpf3B2KF05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Brpf3B2KF05 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brpf3B2KF05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brpf3B2KF05 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brpf3B2KF05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brpf3B2KF05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brpf3B2KF05 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brpf3B2KF05 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Brpf3B2KF05 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Brpf3B2KF05 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brpf3B2KF05 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brpf3B2KF05 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brpf3B2KF05 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brpf3B2KF05 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brpf3B2KF05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brpf3B2KF05 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brpf3B2KF05 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brpf3B2KF05 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Brpf3B2KF05 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brpf3B2KF05 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brpf3B2KF05 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brpf3B2KF05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brpf3B2KF05 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brpf3B2KF05 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brpf3B2KF05 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brpf3B2KF05 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brpf3B2KF05 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms