Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm13178B1AVU7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm13178B1AVU7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm13178B1AVU7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm13178B1AVU7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13178B1AVU7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm13178B1AVU7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm13178B1AVU7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm13178B1AVU7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13178B1AVU7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13178B1AVU7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13178B1AVU7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13178B1AVU7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm13178B1AVU7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm13178B1AVU7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm13178B1AVU7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm13178B1AVU7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm13178B1AVU7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm13178B1AVU7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm13178B1AVU7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms