Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scml2B1AVB3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scml2B1AVB3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scml2B1AVB3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scml2B1AVB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scml2B1AVB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scml2B1AVB3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scml2B1AVB3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scml2B1AVB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scml2B1AVB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scml2B1AVB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scml2B1AVB3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scml2B1AVB3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scml2B1AVB3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scml2B1AVB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scml2B1AVB3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scml2B1AVB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scml2B1AVB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scml2B1AVB3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scml2B1AVB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scml2B1AVB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scml2B1AVB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms