Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slfn8B1ARD8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slfn8B1ARD8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slfn8B1ARD8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slfn8B1ARD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slfn8B1ARD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slfn8B1ARD8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slfn8B1ARD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slfn8B1ARD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slfn8B1ARD8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slfn8B1ARD8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slfn8B1ARD8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slfn8B1ARD8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slfn8B1ARD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Slfn8B1ARD8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slfn8B1ARD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slfn8B1ARD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slfn8B1ARD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slfn8B1ARD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slfn8B1ARD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Slfn8B1ARD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slfn8B1ARD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slfn8B1ARD8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slfn8B1ARD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slfn8B1ARD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Slfn8B1ARD8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slfn8B1ARD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slfn8B1ARD8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slfn8B1ARD8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slfn8B1ARD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slfn8B1ARD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slfn8B1ARD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slfn8B1ARD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slfn8B1ARD8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms