Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M5A7VMS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M5A7VMS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M5A7VMS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M5A7VMS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M5A7VMS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M5A7VMS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M5A7VMS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M5A7VMS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M5A7VMS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-M5A7VMS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M5A7VMS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M5A7VMS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M5A7VMS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M5A7VMS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M5A7VMS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M5A7VMS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M5A7VMS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M5A7VMS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M5A7VMS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M5A7VMS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M5A7VMS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M5A7VMS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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