Protein–RNA interactions for Protein: A2RST7

Vmn1r9, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r9A2RST7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r9A2RST7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r9A2RST7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r9A2RST7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r9A2RST7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r9A2RST7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r9A2RST7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r9A2RST7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r9A2RST7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r9A2RST7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r9A2RST7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r9A2RST7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r9A2RST7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r9A2RST7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r9A2RST7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r9A2RST7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r9A2RST7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r9A2RST7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r9A2RST7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r9A2RST7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r9A2RST7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r9A2RST7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r9A2RST7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r9A2RST7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r9A2RST7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r9A2RST7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r9A2RST7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r9A2RST7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r9A2RST7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms