Protein–RNA interactions for Protein: A2BFL2

Zyg11a, Protein zyg-11 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11aA2BFL2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zyg11aA2BFL2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zyg11aA2BFL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zyg11aA2BFL2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zyg11aA2BFL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zyg11aA2BFL2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zyg11aA2BFL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zyg11aA2BFL2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zyg11aA2BFL2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11aA2BFL2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zyg11aA2BFL2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms