Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap5A2AGT5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap5A2AGT5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap5A2AGT5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap5A2AGT5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap5A2AGT5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap5A2AGT5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ckap5A2AGT5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ckap5A2AGT5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap5A2AGT5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap5A2AGT5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ckap5A2AGT5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap5A2AGT5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap5A2AGT5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ckap5A2AGT5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ckap5A2AGT5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap5A2AGT5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckap5A2AGT5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckap5A2AGT5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap5A2AGT5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap5A2AGT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap5A2AGT5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap5A2AGT5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap5A2AGT5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap5A2AGT5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap5A2AGT5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap5A2AGT5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap5A2AGT5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap5A2AGT5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap5A2AGT5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap5A2AGT5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap5A2AGT5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap5A2AGT5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap5A2AGT5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ckap5A2AGT5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap5A2AGT5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap5A2AGT5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms