Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc25a53A2AF28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc25a53A2AF28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc25a53A2AF28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc25a53A2AF28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc25a53A2AF28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc25a53A2AF28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc25a53A2AF28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc25a53A2AF28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc25a53A2AF28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc25a53A2AF28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc25a53A2AF28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc25a53A2AF28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc25a53A2AF28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a53A2AF28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc25a53A2AF28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc25a53A2AF28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc25a53A2AF28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc25a53A2AF28 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc25a53A2AF28 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc25a53A2AF28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc25a53A2AF28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc25a53A2AF28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc25a53A2AF28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc25a53A2AF28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc25a53A2AF28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc25a53A2AF28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc25a53A2AF28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc25a53A2AF28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc25a53A2AF28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc25a53A2AF28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms