Protein–RNA interactions for Protein: A2A891

Camta1, Calmodulin-binding transcription activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camta1A2A891 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Camta1A2A891 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Camta1A2A891 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Camta1A2A891 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Camta1A2A891 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Camta1A2A891 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Camta1A2A891 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Camta1A2A891 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Camta1A2A891 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Camta1A2A891 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Camta1A2A891 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Camta1A2A891 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Camta1A2A891 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Camta1A2A891 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Camta1A2A891 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Camta1A2A891 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Camta1A2A891 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Camta1A2A891 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Camta1A2A891 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Camta1A2A891 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Camta1A2A891 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camta1A2A891 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Camta1A2A891 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Camta1A2A891 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camta1A2A891 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Camta1A2A891 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camta1A2A891 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Camta1A2A891 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Camta1A2A891 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Camta1A2A891 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Camta1A2A891 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Camta1A2A891 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Camta1A2A891 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Camta1A2A891 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Camta1A2A891 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Camta1A2A891 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Camta1A2A891 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Camta1A2A891 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Camta1A2A891 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Camta1A2A891 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Camta1A2A891 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Camta1A2A891 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Camta1A2A891 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Camta1A2A891 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Camta1A2A891 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Camta1A2A891 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Camta1A2A891 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camta1A2A891 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camta1A2A891 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Camta1A2A891 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Camta1A2A891 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Camta1A2A891 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Camta1A2A891 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Camta1A2A891 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Camta1A2A891 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Camta1A2A891 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Camta1A2A891 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Camta1A2A891 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Camta1A2A891 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Camta1A2A891 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Camta1A2A891 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Camta1A2A891 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Camta1A2A891 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Camta1A2A891 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Camta1A2A891 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Camta1A2A891 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Camta1A2A891 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Camta1A2A891 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Camta1A2A891 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Camta1A2A891 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Camta1A2A891 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms