Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv15A0A0A6YYE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv15A0A0A6YYE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trbv15A0A0A6YYE3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv15A0A0A6YYE3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv15A0A0A6YYE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv15A0A0A6YYE3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv15A0A0A6YYE3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv15A0A0A6YYE3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv15A0A0A6YYE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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