Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW38

Gm28870, Predicted gene 28870, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28870A0A0A6YW38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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Gm28870A0A0A6YW38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28870A0A0A6YW38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28870A0A0A6YW38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28870A0A0A6YW38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28870A0A0A6YW38 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Gm28870A0A0A6YW38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28870A0A0A6YW38 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28870A0A0A6YW38 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28870A0A0A6YW38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Gm28870A0A0A6YW38 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28870A0A0A6YW38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28870A0A0A6YW38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28870A0A0A6YW38 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28870A0A0A6YW38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28870A0A0A6YW38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Gm28870A0A0A6YW38 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28870A0A0A6YW38 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28870A0A0A6YW38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28870A0A0A6YW38 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Gm28870A0A0A6YW38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28870A0A0A6YW38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28870A0A0A6YW38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gm28870A0A0A6YW38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm28870A0A0A6YW38 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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Gm28870A0A0A6YW38 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28870A0A0A6YW38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28870A0A0A6YW38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28870A0A0A6YW38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28870A0A0A6YW38 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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