Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28360A0A087WR25 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm28360A0A087WR25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28360A0A087WR25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28360A0A087WR25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28360A0A087WR25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28360A0A087WR25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28360A0A087WR25 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28360A0A087WR25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28360A0A087WR25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28360A0A087WR25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28360A0A087WR25 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28360A0A087WR25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28360A0A087WR25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28360A0A087WR25 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28360A0A087WR25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28360A0A087WR25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28360A0A087WR25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28360A0A087WR25 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28360A0A087WR25 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28360A0A087WR25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28360A0A087WR25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28360A0A087WR25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28360A0A087WR25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm28360A0A087WR25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28360A0A087WR25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28360A0A087WR25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28360A0A087WR25 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28360A0A087WR25 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28360A0A087WR25 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28360A0A087WR25 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28360A0A087WR25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28360A0A087WR25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28360A0A087WR25 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28360A0A087WR25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28360A0A087WR25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28360A0A087WR25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28360A0A087WR25 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28360A0A087WR25 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28360A0A087WR25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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