Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA5

Gm28961, Predicted gene 28961, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28961A0A087WPA5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28961A0A087WPA5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28961A0A087WPA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28961A0A087WPA5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28961A0A087WPA5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28961A0A087WPA5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28961A0A087WPA5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28961A0A087WPA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28961A0A087WPA5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28961A0A087WPA5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28961A0A087WPA5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28961A0A087WPA5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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