Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm28919A0A087WP35 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm28919A0A087WP35 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm28919A0A087WP35 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm28919A0A087WP35 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm28919A0A087WP35 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm28919A0A087WP35 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm28919A0A087WP35 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm28919A0A087WP35 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm28919A0A087WP35 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm28919A0A087WP35 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm28919A0A087WP35 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm28919A0A087WP35 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm28919A0A087WP35 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm28919A0A087WP35 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm28919A0A087WP35 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm28919A0A087WP35 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm28919A0A087WP35 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm28919A0A087WP35 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm28919A0A087WP35 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm28919A0A087WP35 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm28919A0A087WP35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28919A0A087WP35 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm28919A0A087WP35 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm28919A0A087WP35 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm28919A0A087WP35 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28919A0A087WP35 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28919A0A087WP35 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm28919A0A087WP35 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28919A0A087WP35 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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