Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28510A0A087WP28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28510A0A087WP28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28510A0A087WP28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28510A0A087WP28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28510A0A087WP28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28510A0A087WP28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28510A0A087WP28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms