Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I0

Ighv1-13, Immunoglobulin heavy variable V1-13, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-13A0A075B5I0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv1-13A0A075B5I0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighv1-13A0A075B5I0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ighv1-13A0A075B5I0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv1-13A0A075B5I0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv1-13A0A075B5I0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-13A0A075B5I0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ighv1-13A0A075B5I0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-13A0A075B5I0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-13A0A075B5I0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighv1-13A0A075B5I0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-13A0A075B5I0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv1-13A0A075B5I0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv1-13A0A075B5I0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ighv1-13A0A075B5I0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ighv1-13A0A075B5I0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-13A0A075B5I0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ighv1-13A0A075B5I0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-13A0A075B5I0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-13A0A075B5I0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv1-13A0A075B5I0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-13A0A075B5I0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-13A0A075B5I0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv1-13A0A075B5I0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ighv1-13A0A075B5I0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv1-13A0A075B5I0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv1-13A0A075B5I0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-13A0A075B5I0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-13A0A075B5I0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv1-13A0A075B5I0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-13A0A075B5I0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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