Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubl3Q9Z2M6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ubl3Q9Z2M6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms