Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec2Q9WV35 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apobec2Q9WV35 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apobec2Q9WV35 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apobec2Q9WV35 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apobec2Q9WV35 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms