Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxnb3Q9QY40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxnb3Q9QY40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnb3Q9QY40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.5 ms