Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Edf1Q9JMG1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Edf1Q9JMG1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms