Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco4Q9JIS3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smco4Q9JIS3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smco4Q9JIS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms