Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtofQ9ESF1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OtofQ9ESF1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms