Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx6Q9ER75 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx6Q9ER75 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx6Q9ER75 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms