Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpbpQ9EQI5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms