Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xab2Q9DCD2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xab2Q9DCD2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms