Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic1Q9DC16 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic1Q9DC16 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms